气从意畅,神与境合。
那些单调颜色的单调文字,以极快地速度输出着,在屏幕上刷出一片片残影,让卢赫的脑钟炸出一片片烟花,让他大呼爽快。
虽然各个物种之间有类似的基因片段不足为奇,毕竟用于编码的字符就只有四个,排列组合时多多少少会有些重叠。
但他眼前的这些不一样。即便刷屏速度太快让他看不清具体那些片段具体是什么,但是摘要显示它们很长,有90-150bp不等。这种长度,绝非巧合。
激动的心,颤抖的手。打开日志文档,第一行记录就直击了他的内心。他清楚地记得那一串号码,是被充公了的卷柏——那个可怜小煤球的基因组编号。
他时不时地会专程去看望它,隔着厚厚的玻璃欣赏它已经完全展开的翠绿叶片。他觉得那无量的苍绿是世界上最美的东西。
当然,真正让他惊叹的不仅如此。编号后面跟随了多到暂时无法计数的、与鼠爵基因组中的一段几乎完全相同的重复长片段。
之所以说是几乎,是因为它们并不完全一致。开头一小段一样、结尾一小段一样、中间被一大段意义不明的片段所中断。
它们像是一块块很不正经的夹心饼干,两块饼干片普普通通,但夹心多到立起来能直冲天花板。奥利利利。。。利利利奥。
于是,他立刻拷贝下这坨恶趣味的东西,颠颠地跑向了“植物逆境生物学研究中心”,刷开了门。
拥有了通行权限的人,走起路来都是昂首挺胸的。气宇轩昂地走到竺丘的跟前,咣当一声把u盘扔到桌子上。
睡得正香地竺丘被吓得哆嗦了一下,迷糊地望着对面那个曾隔不了几天就来骚扰一下自己的人,本能地怒道:
“我不是都给你开权限了吗?要看就自己去看,别来烦我!没完没了的!”
卢赫不以为然地冲u盘仰了仰下巴,“最新发现,不感兴趣吗?”
竺丘强打起精神,揉着眼睛直起身,拾起u盘往拓展坞上插,然后又瘫了回去。
在此期间,卢赫的目光始终无法从竺丘的大肚皮上移开,“我一直很好奇你是怎么长胖的?按理说每个人的配给都是一样的,我怎么就要么吃不饱要么吃不好?
难不成你们管种菜的这波人,能够近水楼台先得月?你要不看在我奉献了一株草的份上,赏我个土豆吃?”
竺丘不解地望了卢赫一眼,抬手把自己的工牌翻了个面,指着其上玉树临风的半身照说:
“看见没?我以前长这样。我还想知道我是怎么胖的呢,自从。。。”
他只说了一半,眼睛就再也无法从电脑屏幕上移开,眉头蹙成一团。
“看得懂吗?”卢赫贴心地问。
“看不懂!”竺丘狠狠回答。
“我给你解释一下,你看到那些重复的基因片段没,这都是非编码区里的。抛开中间那段乱七八糟的东西不谈,开头和结尾的拼起来,和我们的绅士大老鼠体内的一段一摸一样。”卢赫说着,十分期待对方的反应。
“和什么东西的一样?”竺丘的眉头越皱越紧,丰满的眉角被生生拧出了鱼尾纹。
“大老鼠!”卢赫一字一顿。
“握草!”
竺丘从椅子上弹射而起,墩墩地跑走了。
卢赫对竺丘的反应十分满意,心满意足地坐在那张看起来很舒适的老板椅上,翘着二郎腿眯起眼睛。
虽然冷漠小机器人还在辛勤工作着,但他并不急于去分析其余那些如雪花片一样密密麻麻令人眼晕的字符。
他现在最为挂念的是他的小煤球,一个很可能是世界唯一的幸存者、一个可能让一切都重燃生机的希望。
钱钟书说过,要最希望的事能实现,还是先对它绝望,准备将来有出于望外的惊喜。
他们已经绝望很久了,如果老天爷还有心的话,是该到否极泰来的时候了。
等待是漫长的,但也是幸福的,幸福到迎着24小时彻亮的刺眼灯光睡着了。
不知过了多久,他被两声巨响惊醒。
迷茫睁眼,面前是一厚叠的纸,和一根洗净了的胡萝卜。
头脑还没苏醒的他,本能地忽略掉其上密密麻麻印刷着蚂蚁字的纸,握着胡萝卜送到嘴边。
下嘴之前,还小心地望着竺丘,直到对方点头。
伴随着清脆的喀吱声,清甜的汁水在口腔炸开,像是琼浆玉露,好吃到他头皮发麻。
一口气消灭掉半根后,他后知后觉般地顿了一下,低头看了一眼手里的东西,惊坐拍桌:
“我就知道!你们这帮人是妥妥的特权阶级,你还不承认!”
竺丘一脸无奈:“你想多了,这本就是今晚要给食堂送的菜,只不过多给你吃一根而已。你立功了,本来想赏你土豆的,但生吃土豆对身体不好。”
“快点吃,吃完赶紧看!”竺丘指了指那叠厚厚的报告。
卢赫珍惜地把剩余半根揣进兜里,埋头一张一张翻阅起来。
“看得懂吗?”竺丘问。
“看得懂!”卢赫狠狠回答,“你们发现这些夹心饼干的饼干片在好多别的植物的基因组里都有,并且和早年间记录下来的基因组数据相比,其下游或多或少带了些意义不明的突变。可是夹心呢?难道那是我那株草独有的?”
“没错。”竺丘点头,“那是唯独它能活着的最可能的原因。你所说的一大段夹心,其实是转座子。
转座子知道吧?是一段可以移动的遗传物质,它可以从原位上单独复制和断裂下来,插入到其它位点,起到调控基因表达的作用。
转座子有两类,一类叫做‘反转座子’,先转录为rna,然后rna再逆转录为dna,插入到特定的位点。是复制粘贴。
另外一类叫做‘dna转座子’,不复制自己,而是直接移位,是剪切粘贴。
很显然,你那株草的情况属于第一类。
这就是它能活着的原因。它的这个转座子疯狂复制粘贴,贴到了两块饼干皮之间。
当然,这需要后续验证。不过应该没有什么悬念。”
卢赫思索片刻,脸上逐渐写满意外,“既然死了的植物都有饼干皮,活着的却夹了心。难道那两块和大老鼠一样的饼干皮才是植物萎了的真正原因,而不是那些突变?”
“不全对。”竺丘连连摇头,“我们已经证实了,那两块饼干皮并不会表达出什么功能,它可能是一种原因,但绝不是直接原因。
不过转座子夹心破坏了本应是一体的两块饼干皮,确实让它活下来了。”
“那你们准备怎么验证这个猜想?”卢赫追问。
“这个不难。转座子虽然使得生命的进化有了更多可能性,但也可能导致很多致命的突变。为了活着,生物也会有相应的应对方法。
比如利用干扰小rna(sirna)触发并维持转座子(te)表观沉默的机制。由rna聚合酶pol iv和pol v介导的dna甲基化rddm途径作用于已含有甲基化修饰的转座子,以增强的沉默状态。
我们可以通过这种机制,将那株草组织里未激活的活着已甲基化的转座子失活,如果失活后草的活力下降,就可以验证猜想。
至于已激活的或未被甲基化修饰的转座子则通过rna依赖的rna聚合酶6(rdr6)介导产生21-22 nt的sirna,触发rnai和从头开始的dna甲基化,这个过程被称为rdr6-rddm。”
竺丘说到一半,停下来注视着卢赫,“听得懂吗?”
“听不懂!”卢赫狠狠回答。
竺丘大手一挥,“听不懂就赶紧滚!你不是协调了好多个物种的基因库吗?赶紧看看除了植物以外,还有没有别的东西有类似的现象!”
“用你说!”卢赫愤愤地离开了。
回到冷漠小机器人的身边,他迫不及待地打开日志,写下一个处理程序把摘要里的基因组识别码与基因库里的物种信息相匹配。
虽然有一定的心理准备,可处理结果让他大跌眼镜。
除了植物以外,拥有饼干皮的还有一些原核生物和人!
当然,这个“人”并不是指的全人类,而是有数据记录的、感染腺病毒后正在发生基因突变的人。
这个结果让他久久地愣住,很显然,老天爷给他们施舍下一个惊喜的同时,也丢下了一个崭新的惊吓。
虽然还不知道这些饼干皮的作用,但他的脑海中不自主地冒出了一个无厘头的想法。
在查尔斯·达尔文发表着名的进化论之前,大多数博物学家们都认为自然界中的现象——从兰花的花瓣到秃鹫喙上的钩——都是造物主设计出来的杰作。
在达尔文的理论得到广泛接受之后,他们又开始将其视为自然选择的产物,认为生物的方方面面都是精确适应的结果。
然而,生物学家们却不这么看。他们认为充分高效的基因组与我们起源的随意性不符,每一个物种都应是在无数次错误的尝试中偶然诞生的。
所以我们才能既可以在数十亿碱基里看到一架调控精妙的机器,又也可以看到一片狼藉的屎山。
也许,这二者不矛盾。
毕竟,屎山里面也可能埋金子的。
这些同时拥有饼干皮的物种,从生活环境到进化历史都毫无相似之处可言。
历史经验证明,如果有多个截然不同的物种会不约而同地同时保留一串废物,那么这废物,就必定不是废物。
想到这里,他不由地打了个哈欠,目光瞥向自己亮起来的手机屏幕。
又是急会。
这次的缘由是,那两个脑子瓦特的人,情况恶化了。
那些单调颜色的单调文字,以极快地速度输出着,在屏幕上刷出一片片残影,让卢赫的脑钟炸出一片片烟花,让他大呼爽快。
虽然各个物种之间有类似的基因片段不足为奇,毕竟用于编码的字符就只有四个,排列组合时多多少少会有些重叠。
但他眼前的这些不一样。即便刷屏速度太快让他看不清具体那些片段具体是什么,但是摘要显示它们很长,有90-150bp不等。这种长度,绝非巧合。
激动的心,颤抖的手。打开日志文档,第一行记录就直击了他的内心。他清楚地记得那一串号码,是被充公了的卷柏——那个可怜小煤球的基因组编号。
他时不时地会专程去看望它,隔着厚厚的玻璃欣赏它已经完全展开的翠绿叶片。他觉得那无量的苍绿是世界上最美的东西。
当然,真正让他惊叹的不仅如此。编号后面跟随了多到暂时无法计数的、与鼠爵基因组中的一段几乎完全相同的重复长片段。
之所以说是几乎,是因为它们并不完全一致。开头一小段一样、结尾一小段一样、中间被一大段意义不明的片段所中断。
它们像是一块块很不正经的夹心饼干,两块饼干片普普通通,但夹心多到立起来能直冲天花板。奥利利利。。。利利利奥。
于是,他立刻拷贝下这坨恶趣味的东西,颠颠地跑向了“植物逆境生物学研究中心”,刷开了门。
拥有了通行权限的人,走起路来都是昂首挺胸的。气宇轩昂地走到竺丘的跟前,咣当一声把u盘扔到桌子上。
睡得正香地竺丘被吓得哆嗦了一下,迷糊地望着对面那个曾隔不了几天就来骚扰一下自己的人,本能地怒道:
“我不是都给你开权限了吗?要看就自己去看,别来烦我!没完没了的!”
卢赫不以为然地冲u盘仰了仰下巴,“最新发现,不感兴趣吗?”
竺丘强打起精神,揉着眼睛直起身,拾起u盘往拓展坞上插,然后又瘫了回去。
在此期间,卢赫的目光始终无法从竺丘的大肚皮上移开,“我一直很好奇你是怎么长胖的?按理说每个人的配给都是一样的,我怎么就要么吃不饱要么吃不好?
难不成你们管种菜的这波人,能够近水楼台先得月?你要不看在我奉献了一株草的份上,赏我个土豆吃?”
竺丘不解地望了卢赫一眼,抬手把自己的工牌翻了个面,指着其上玉树临风的半身照说:
“看见没?我以前长这样。我还想知道我是怎么胖的呢,自从。。。”
他只说了一半,眼睛就再也无法从电脑屏幕上移开,眉头蹙成一团。
“看得懂吗?”卢赫贴心地问。
“看不懂!”竺丘狠狠回答。
“我给你解释一下,你看到那些重复的基因片段没,这都是非编码区里的。抛开中间那段乱七八糟的东西不谈,开头和结尾的拼起来,和我们的绅士大老鼠体内的一段一摸一样。”卢赫说着,十分期待对方的反应。
“和什么东西的一样?”竺丘的眉头越皱越紧,丰满的眉角被生生拧出了鱼尾纹。
“大老鼠!”卢赫一字一顿。
“握草!”
竺丘从椅子上弹射而起,墩墩地跑走了。
卢赫对竺丘的反应十分满意,心满意足地坐在那张看起来很舒适的老板椅上,翘着二郎腿眯起眼睛。
虽然冷漠小机器人还在辛勤工作着,但他并不急于去分析其余那些如雪花片一样密密麻麻令人眼晕的字符。
他现在最为挂念的是他的小煤球,一个很可能是世界唯一的幸存者、一个可能让一切都重燃生机的希望。
钱钟书说过,要最希望的事能实现,还是先对它绝望,准备将来有出于望外的惊喜。
他们已经绝望很久了,如果老天爷还有心的话,是该到否极泰来的时候了。
等待是漫长的,但也是幸福的,幸福到迎着24小时彻亮的刺眼灯光睡着了。
不知过了多久,他被两声巨响惊醒。
迷茫睁眼,面前是一厚叠的纸,和一根洗净了的胡萝卜。
头脑还没苏醒的他,本能地忽略掉其上密密麻麻印刷着蚂蚁字的纸,握着胡萝卜送到嘴边。
下嘴之前,还小心地望着竺丘,直到对方点头。
伴随着清脆的喀吱声,清甜的汁水在口腔炸开,像是琼浆玉露,好吃到他头皮发麻。
一口气消灭掉半根后,他后知后觉般地顿了一下,低头看了一眼手里的东西,惊坐拍桌:
“我就知道!你们这帮人是妥妥的特权阶级,你还不承认!”
竺丘一脸无奈:“你想多了,这本就是今晚要给食堂送的菜,只不过多给你吃一根而已。你立功了,本来想赏你土豆的,但生吃土豆对身体不好。”
“快点吃,吃完赶紧看!”竺丘指了指那叠厚厚的报告。
卢赫珍惜地把剩余半根揣进兜里,埋头一张一张翻阅起来。
“看得懂吗?”竺丘问。
“看得懂!”卢赫狠狠回答,“你们发现这些夹心饼干的饼干片在好多别的植物的基因组里都有,并且和早年间记录下来的基因组数据相比,其下游或多或少带了些意义不明的突变。可是夹心呢?难道那是我那株草独有的?”
“没错。”竺丘点头,“那是唯独它能活着的最可能的原因。你所说的一大段夹心,其实是转座子。
转座子知道吧?是一段可以移动的遗传物质,它可以从原位上单独复制和断裂下来,插入到其它位点,起到调控基因表达的作用。
转座子有两类,一类叫做‘反转座子’,先转录为rna,然后rna再逆转录为dna,插入到特定的位点。是复制粘贴。
另外一类叫做‘dna转座子’,不复制自己,而是直接移位,是剪切粘贴。
很显然,你那株草的情况属于第一类。
这就是它能活着的原因。它的这个转座子疯狂复制粘贴,贴到了两块饼干皮之间。
当然,这需要后续验证。不过应该没有什么悬念。”
卢赫思索片刻,脸上逐渐写满意外,“既然死了的植物都有饼干皮,活着的却夹了心。难道那两块和大老鼠一样的饼干皮才是植物萎了的真正原因,而不是那些突变?”
“不全对。”竺丘连连摇头,“我们已经证实了,那两块饼干皮并不会表达出什么功能,它可能是一种原因,但绝不是直接原因。
不过转座子夹心破坏了本应是一体的两块饼干皮,确实让它活下来了。”
“那你们准备怎么验证这个猜想?”卢赫追问。
“这个不难。转座子虽然使得生命的进化有了更多可能性,但也可能导致很多致命的突变。为了活着,生物也会有相应的应对方法。
比如利用干扰小rna(sirna)触发并维持转座子(te)表观沉默的机制。由rna聚合酶pol iv和pol v介导的dna甲基化rddm途径作用于已含有甲基化修饰的转座子,以增强的沉默状态。
我们可以通过这种机制,将那株草组织里未激活的活着已甲基化的转座子失活,如果失活后草的活力下降,就可以验证猜想。
至于已激活的或未被甲基化修饰的转座子则通过rna依赖的rna聚合酶6(rdr6)介导产生21-22 nt的sirna,触发rnai和从头开始的dna甲基化,这个过程被称为rdr6-rddm。”
竺丘说到一半,停下来注视着卢赫,“听得懂吗?”
“听不懂!”卢赫狠狠回答。
竺丘大手一挥,“听不懂就赶紧滚!你不是协调了好多个物种的基因库吗?赶紧看看除了植物以外,还有没有别的东西有类似的现象!”
“用你说!”卢赫愤愤地离开了。
回到冷漠小机器人的身边,他迫不及待地打开日志,写下一个处理程序把摘要里的基因组识别码与基因库里的物种信息相匹配。
虽然有一定的心理准备,可处理结果让他大跌眼镜。
除了植物以外,拥有饼干皮的还有一些原核生物和人!
当然,这个“人”并不是指的全人类,而是有数据记录的、感染腺病毒后正在发生基因突变的人。
这个结果让他久久地愣住,很显然,老天爷给他们施舍下一个惊喜的同时,也丢下了一个崭新的惊吓。
虽然还不知道这些饼干皮的作用,但他的脑海中不自主地冒出了一个无厘头的想法。
在查尔斯·达尔文发表着名的进化论之前,大多数博物学家们都认为自然界中的现象——从兰花的花瓣到秃鹫喙上的钩——都是造物主设计出来的杰作。
在达尔文的理论得到广泛接受之后,他们又开始将其视为自然选择的产物,认为生物的方方面面都是精确适应的结果。
然而,生物学家们却不这么看。他们认为充分高效的基因组与我们起源的随意性不符,每一个物种都应是在无数次错误的尝试中偶然诞生的。
所以我们才能既可以在数十亿碱基里看到一架调控精妙的机器,又也可以看到一片狼藉的屎山。
也许,这二者不矛盾。
毕竟,屎山里面也可能埋金子的。
这些同时拥有饼干皮的物种,从生活环境到进化历史都毫无相似之处可言。
历史经验证明,如果有多个截然不同的物种会不约而同地同时保留一串废物,那么这废物,就必定不是废物。
想到这里,他不由地打了个哈欠,目光瞥向自己亮起来的手机屏幕。
又是急会。
这次的缘由是,那两个脑子瓦特的人,情况恶化了。